Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
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