Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
SQLEQ14534 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms