Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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