Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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