Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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CALCOCO2Q13137 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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