Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms