Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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