Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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