Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PTPN13Q12923 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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