Protein–RNA interactions for Protein: Q11206

ST3GAL4, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL4Q11206 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ST3GAL4Q11206 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ST3GAL4Q11206 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ST3GAL4Q11206 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ST3GAL4Q11206 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ST3GAL4Q11206 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ST3GAL4Q11206 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ST3GAL4Q11206 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ST3GAL4Q11206 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ST3GAL4Q11206 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ST3GAL4Q11206 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms