Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG06

FAAP100, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP100Q0VG06 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAAP100Q0VG06 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAAP100Q0VG06 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAAP100Q0VG06 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAAP100Q0VG06 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAAP100Q0VG06 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAAP100Q0VG06 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAAP100Q0VG06 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAAP100Q0VG06 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms