Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D2

FAM69C, Protein FAM69C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69CQ0P6D2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM69CQ0P6D2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM69CQ0P6D2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms