Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSRP1Q08945 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms