Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms