Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FMODQ06828 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FMODQ06828 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FMODQ06828 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms