Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KCNC4Q03721 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNC4Q03721 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms