Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHDQ02161 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHDQ02161 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHDQ02161 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHDQ02161 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHDQ02161 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHDQ02161 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHDQ02161 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHDQ02161 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHDQ02161 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHDQ02161 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHDQ02161 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHDQ02161 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHDQ02161 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHDQ02161 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHDQ02161 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHDQ02161 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RHDQ02161 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHDQ02161 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHDQ02161 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHDQ02161 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHDQ02161 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHDQ02161 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHDQ02161 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHDQ02161 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHDQ02161 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHDQ02161 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHDQ02161 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHDQ02161 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHDQ02161 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHDQ02161 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms