Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP1Q00587 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP1Q00587 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms