Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms