Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.4 ms