Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms