Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P62684 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P62684 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms