Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P61574 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms