Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms