Protein–RNA interactions for Protein: P59826

BPIFB3, BPI fold-containing family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFB3P59826 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPIFB3P59826 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms