Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms