Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPOP42166 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPOP42166 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPOP42166 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPOP42166 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPOP42166 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPOP42166 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPOP42166 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPOP42166 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPOP42166 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPOP42166 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPOP42166 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMPOP42166 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMPOP42166 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMPOP42166 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMPOP42166 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPOP42166 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPOP42166 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPOP42166 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPOP42166 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPOP42166 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPOP42166 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPOP42166 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPOP42166 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPOP42166 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPOP42166 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPOP42166 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPOP42166 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPOP42166 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPOP42166 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPOP42166 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPOP42166 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPOP42166 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPOP42166 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPOP42166 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPOP42166 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPOP42166 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPOP42166 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPOP42166 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPOP42166 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPOP42166 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPOP42166 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPOP42166 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPOP42166 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPOP42166 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPOP42166 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPOP42166 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPOP42166 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPOP42166 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPOP42166 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPOP42166 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPOP42166 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPOP42166 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPOP42166 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPOP42166 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPOP42166 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPOP42166 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPOP42166 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPOP42166 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPOP42166 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPOP42166 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPOP42166 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPOP42166 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPOP42166 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPOP42166 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPOP42166 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPOP42166 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPOP42166 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPOP42166 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPOP42166 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPOP42166 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPOP42166 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPOP42166 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPOP42166 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPOP42166 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPOP42166 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPOP42166 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPOP42166 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPOP42166 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPOP42166 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPOP42166 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPOP42166 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPOP42166 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPOP42166 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPOP42166 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPOP42166 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPOP42166 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPOP42166 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPOP42166 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPOP42166 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPOP42166 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPOP42166 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPOP42166 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPOP42166 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPOP42166 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPOP42166 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPOP42166 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPOP42166 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPOP42166 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPOP42166 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms