Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK1P39086 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms