Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDIT3P35638 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT3P35638 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms