Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms