Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA9P31269 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA9P31269 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms