Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms