Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PSMB9P28065 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSMB9P28065 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms