Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.2 ms