Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms