Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT1P21579 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT1P21579 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT1P21579 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT1P21579 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT1P21579 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT1P21579 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT1P21579 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT1P21579 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT1P21579 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT1P21579 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT1P21579 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT1P21579 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT1P21579 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT1P21579 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT1P21579 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT1P21579 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT1P21579 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT1P21579 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT1P21579 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT1P21579 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT1P21579 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT1P21579 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT1P21579 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT1P21579 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT1P21579 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT1P21579 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT1P21579 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT1P21579 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT1P21579 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT1P21579 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT1P21579 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT1P21579 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT1P21579 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT1P21579 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT1P21579 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT1P21579 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT1P21579 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT1P21579 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT1P21579 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT1P21579 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT1P21579 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT1P21579 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT1P21579 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT1P21579 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT1P21579 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT1P21579 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT1P21579 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT1P21579 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT1P21579 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT1P21579 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT1P21579 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT1P21579 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT1P21579 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT1P21579 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT1P21579 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT1P21579 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT1P21579 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT1P21579 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT1P21579 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT1P21579 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT1P21579 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT1P21579 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT1P21579 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT1P21579 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT1P21579 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT1P21579 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT1P21579 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT1P21579 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT1P21579 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms