Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASTP20810 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASTP20810 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASTP20810 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASTP20810 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASTP20810 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASTP20810 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASTP20810 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASTP20810 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASTP20810 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASTP20810 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASTP20810 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASTP20810 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASTP20810 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASTP20810 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CASTP20810 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASTP20810 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASTP20810 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASTP20810 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASTP20810 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASTP20810 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASTP20810 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASTP20810 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASTP20810 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASTP20810 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASTP20810 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASTP20810 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASTP20810 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASTP20810 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASTP20810 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASTP20810 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASTP20810 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASTP20810 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASTP20810 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASTP20810 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASTP20810 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASTP20810 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASTP20810 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASTP20810 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASTP20810 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASTP20810 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASTP20810 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASTP20810 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASTP20810 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASTP20810 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASTP20810 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASTP20810 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASTP20810 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASTP20810 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASTP20810 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASTP20810 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASTP20810 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASTP20810 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASTP20810 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CASTP20810 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CASTP20810 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CASTP20810 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASTP20810 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASTP20810 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASTP20810 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASTP20810 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASTP20810 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASTP20810 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASTP20810 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASTP20810 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASTP20810 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASTP20810 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASTP20810 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASTP20810 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASTP20810 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASTP20810 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASTP20810 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASTP20810 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASTP20810 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASTP20810 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASTP20810 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASTP20810 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASTP20810 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASTP20810 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASTP20810 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASTP20810 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASTP20810 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASTP20810 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASTP20810 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms