Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms