Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms