Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLP19338 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLP19338 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLP19338 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLP19338 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLP19338 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLP19338 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLP19338 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLP19338 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLP19338 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLP19338 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLP19338 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLP19338 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLP19338 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLP19338 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLP19338 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLP19338 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLP19338 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLP19338 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLP19338 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLP19338 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLP19338 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLP19338 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLP19338 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLP19338 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLP19338 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCLP19338 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLP19338 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLP19338 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLP19338 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLP19338 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLP19338 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLP19338 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLP19338 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLP19338 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLP19338 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLP19338 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLP19338 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLP19338 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLP19338 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLP19338 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLP19338 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLP19338 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLP19338 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLP19338 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLP19338 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLP19338 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLP19338 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLP19338 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLP19338 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCLP19338 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCLP19338 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCLP19338 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCLP19338 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCLP19338 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCLP19338 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCLP19338 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCLP19338 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCLP19338 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCLP19338 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCLP19338 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCLP19338 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NCLP19338 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCLP19338 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NCLP19338 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCLP19338 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCLP19338 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCLP19338 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCLP19338 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCLP19338 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCLP19338 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCLP19338 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCLP19338 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCLP19338 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCLP19338 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCLP19338 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCLP19338 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCLP19338 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCLP19338 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCLP19338 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCLP19338 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCLP19338 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCLP19338 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCLP19338 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCLP19338 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCLP19338 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCLP19338 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCLP19338 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCLP19338 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCLP19338 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCLP19338 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCLP19338 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCLP19338 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCLP19338 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCLP19338 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCLP19338 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCLP19338 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCLP19338 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCLP19338 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCLP19338 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms