Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XBP1P17861 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XBP1P17861 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XBP1P17861 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms