Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRG2P13727 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRG2P13727 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRG2P13727 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRG2P13727 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRG2P13727 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRG2P13727 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRG2P13727 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRG2P13727 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRG2P13727 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRG2P13727 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRG2P13727 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRG2P13727 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRG2P13727 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms