Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXD8P13378 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms