Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAMP11215 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms