Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C8orf88P0DMB2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms