Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NGFRP08138 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NGFRP08138 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NGFRP08138 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NGFRP08138 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NGFRP08138 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NGFRP08138 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NGFRP08138 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NGFRP08138 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NGFRP08138 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NGFRP08138 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NGFRP08138 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms