Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPBP07199 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBP07199 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBP07199 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBP07199 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBP07199 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBP07199 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBP07199 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBP07199 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBP07199 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBP07199 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBP07199 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBP07199 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBP07199 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBP07199 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBP07199 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBP07199 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBP07199 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBP07199 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBP07199 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBP07199 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBP07199 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBP07199 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBP07199 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPBP07199 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CENPBP07199 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CENPBP07199 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CENPBP07199 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPBP07199 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPBP07199 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPBP07199 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPBP07199 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPBP07199 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPBP07199 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPBP07199 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPBP07199 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPBP07199 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPBP07199 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPBP07199 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPBP07199 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPBP07199 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPBP07199 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPBP07199 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPBP07199 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPBP07199 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPBP07199 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPBP07199 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPBP07199 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPBP07199 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPBP07199 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPBP07199 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPBP07199 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPBP07199 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPBP07199 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPBP07199 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBP07199 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBP07199 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBP07199 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBP07199 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBP07199 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBP07199 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBP07199 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBP07199 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBP07199 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBP07199 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBP07199 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBP07199 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBP07199 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBP07199 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBP07199 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBP07199 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBP07199 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBP07199 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBP07199 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBP07199 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBP07199 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBP07199 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBP07199 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms