Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms