Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD4O95243 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD4O95243 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD4O95243 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD4O95243 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD4O95243 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD4O95243 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD4O95243 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD4O95243 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD4O95243 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD4O95243 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD4O95243 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD4O95243 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD4O95243 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD4O95243 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD4O95243 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD4O95243 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD4O95243 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD4O95243 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD4O95243 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD4O95243 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD4O95243 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD4O95243 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD4O95243 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD4O95243 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD4O95243 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD4O95243 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD4O95243 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD4O95243 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD4O95243 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD4O95243 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD4O95243 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD4O95243 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD4O95243 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD4O95243 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD4O95243 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD4O95243 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD4O95243 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD4O95243 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD4O95243 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD4O95243 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD4O95243 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD4O95243 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD4O95243 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD4O95243 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD4O95243 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD4O95243 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD4O95243 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD4O95243 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD4O95243 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD4O95243 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD4O95243 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD4O95243 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD4O95243 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD4O95243 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD4O95243 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD4O95243 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD4O95243 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD4O95243 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD4O95243 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD4O95243 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD4O95243 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD4O95243 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MBD4O95243 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MBD4O95243 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MBD4O95243 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MBD4O95243 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MBD4O95243 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD4O95243 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD4O95243 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD4O95243 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD4O95243 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD4O95243 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD4O95243 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD4O95243 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD4O95243 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD4O95243 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD4O95243 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD4O95243 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD4O95243 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD4O95243 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD4O95243 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD4O95243 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD4O95243 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD4O95243 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD4O95243 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD4O95243 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD4O95243 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD4O95243 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms