Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms